南苏丹面积大约60多万平方公里，人口约万左右，首都朱巴人口约37万。和富庶的北苏丹相比，南苏丹十分贫穷落后，基础设施匮乏，相当于法国面积的领土上居然只有38公里铺设路面的公路，只有2%的苏丹人有小学文化程度，文盲率高达85%，许多非洲媒体都担心，南苏丹将是非洲这个最贫穷大洲的最贫穷国家。

位居于世界上最贫穷落后的地区之一，南苏丹生活水平低下，卫生环境恶劣。各大城镇之间没有像样的公路。首府朱巴，居民大多居住在传统的茅草房内，市内没有市政供水管网，居民用水只能依靠供水车，或者自己到白尼罗河取水。联合国统计数据表明，在万南苏丹人口中，超过半数无法获得清洁水源、超过90%的儿童没有接种疫苗。

南方内部也存在着很多矛盾。南方民族众多，部族之间的斗争时有发生。主体民族丁卡人和努尔人之间存在矛盾；巴里人是首都朱巴的原住民，大批丁卡人和努尔人的到来，在巴里人看来成为了某种意义上的占领。非政府组织国际危机小组在报告中写道：“在南苏丹，地区认同和部落认同比任何国家认同都要强。”美国国际战略研究中心非洲项目副主任当尼认为，民众普遍认为让南苏丹团结起来的是对北方的恨；因此，一旦南苏丹独立，南部部落政治将很快浮出水面。

南苏丹目前有20多个党派组织，在政府拥有代表的政党共9家：苏丹人民解放运动、全国大会党、苏丹非洲联盟、团结民主阵线、苏丹非洲党第一联盟、苏丹非洲党第二联盟、团结民主拯救阵线、南苏丹民主论坛、非洲全国大会党。丁卡人在南方政府、执政党和军队中掌握绝对主导权，引起其他民族议论。南苏丹还存在着反政府武装，10个州中有5、6个州内部存在冲突。

就在年1月南方公投时，乔治·阿瑟领导的叛乱武装违反与南方自治政府早些时候达成的停火协定，袭击了南方上尼罗州的城镇凡加克和多尔。几天的军事冲突造成了多人伤亡。军队方面，包括苏丹人民解放军、警察和监狱部门在内，有20个人在凡加克镇被杀，阿瑟手下有30个人死亡，另有数十名平民被杀害，其中包括妇女和儿童。双方相互指责对方先发动进攻。乔治·阿瑟原本是苏丹南方军队的将领，因年竞选琼莱州长失败而恼怒，拉起部下另立山头反叛南苏丹当局。南方政府认为乔治·阿瑟及其追随者受北方政府指使，蓄谋破坏南方稳定。

联合国负责维和事务的助理秘书长哈雷指出，公投结束后南部局势日趋紧张，苏丹人民解放运动和众多反叛武装发生冲突，对琼莱州、上尼罗州和团结州的平民构成了严重的安全威胁。

以丰富的石油资源为依托，南方人民对国家独立带来繁荣怀着殷切的期盼，南苏丹领导人抒发了“成为第二个阿联酋”的愿景，但是，如果说过去的不满问题可以归罪于阿拉伯人北方政权的话，今后的问题就要由南苏丹黑人新政府来承担了。